Preparo para o exame: O preparo para a coleta de biópsia sólida deve seguir as recomendações médicas, variando conforme a metodologia aplicada, seja ela invasiva ou não.
Amostra: Para amostras sólidas, um bloco de FFPE é suficiente se o tecido apresentar o número adequado de células neoplásicas, sendo ≥ 50% para BRAF. Do contrário, serão necessários múltiplos tecidos em FFPE para atender a esse requisito e nesse caso, a espessura do corte tecidual terá variação mínima e máxima, conforme indicado na tabela:
Coleta: A coleta de material biológico varia conforme o tipo de biópsia, que pode ser sólida (tecido e/ou tumor) ou líquida (plasma sanguíneo). A biópsia sólida pode ser realizada de forma invasiva (utilizando equipamentos adequados e/ou procedimentos cirúrgicos), como em casos de câncer colorretal e câncer de pulmão ou pode ser executada através de incisões superficiais na pele, como no caso do melanoma.
Estabilidade das amostras: As amostras sólidas devem ser mergulhadas no fixador o mais rápido possível, para reduzir a degradação do DNA, com um prazo máximo de uma hora. Após o tratamento e processamento das amostras para inclusão em blocos de parafina, ocorrerá a análise do conteúdo tumoral. A porção destinada ao uso no Idylla™ deve ser armazenada entre 15-30°C por até 60 dias.
Transporte de amostras: As amostras de tecido em FFPE devem ser enviadas previamente seccionadas em formato de rolinhos (FFPE curls) e acondicionadas em microtubos plásticos, sem a adição de reagentes ou água (DNAse/RNAse free). A temperatura de transporte deve ser mantida entre 15-30°C. Para garantir a integridade do material, é importante evitar agitações durante o transporte.
Critérios para rejeição da amostra: Fora do período de estabilidade, amostra congelada ou refrigerada, quantidade insuficiente de amostra coletada, amostra armazenada em tubo contendo reagentes ou água, amostras biológicas e/ou tubos não identificados adequadamente, tubos e/ou recipientes danificados e amostras FFPE coradas.
Indicação clínica: Pacientes com suspeita de doenças oncológicas decorrentes de alterações genéticas somáticas em melanoma.
Metodologia: Utilizando biópsias sólidas e a técnica de PCR em tempo real, é realizada a detecção automatizada de biomarcadores associados a doenças oncológicas. Após a inserção da amostra biológica (biópsia sólida) em um cartucho específico do Idylla™, ocorre uma combinação de reagentes químicos, enzimas, calor e ultrassom focalizado de alta intensidade (HIFU), que induzem a desparafinização, ruptura do tecido e lise das células. Os ácidos nucleicos são então liberados e amplificados através da técnica de PCR em tempo real, onde as sequências-alvo para os biomarcadores BRAF são detectadas por sondas marcadas com fluorescência.
Durante o processo de PCR em tempo real, são gerados sinais fluorescentes que são traduzidos em chamadas genéticas, permitindo ao software TTP interpretá-las automaticamente e gerar um relatório dos resultados (inválido, presença ou ausência de mutação).
Vantagens: O sistema Idylla™ desenvolvido para testes onco-moleculares é totalmente automatizado, reduzindo eficientemente o risco de contaminações cruzadas de reagentes e das amostras de biópsia. Com a utilização da técnica de PCR em tempo real qualitativa, os resultados são concluídos em um curto período. O ensaio de mutação Idylla™ BRAF detecta mutações V600E/D e V600K/R/M no códon 600 do gene BRAF.
Limitações da metodologia: A detecção de alterações não é possível, caso as amostras de biópsia sólida não contenham um número suficiente de células neoplásicas, sendo necessário ≥ 50% para BRAF. Casos de raros mutações, como V600G, não são detectadas pelo Idylla™ BRAF.
Interferentes: O uso de amostras coradas ou embebidas em parafina com temperatura de fusão acima de 60 °C, pode gerar resultados inválidos e/ou incorretos.
Prazo: 3 dias
Preparo para o exame: O preparo para a coleta de biópsia sólida deve seguir as recomendações médicas, variando conforme a metodologia aplicada, seja ela invasiva ou não.
Amostra: Para amostras sólidas, um bloco de FFPE é suficiente se o tecido apresentar o número adequado de células neoplásicas, sendo ≥10% para EGFR. Do contrário, serão necessários múltiplos tecidos em FFPE para atender a esse requisito e nesse caso, a espessura do corte tecidual terá variação mínima e máxima, conforme indicado na tabela:
Coleta: A coleta de material biológico varia conforme o tipo de biópsia, que pode ser sólida (tecido e/ou tumor) ou líquida (plasma sanguíneo). A biópsia sólida pode ser realizada de forma invasiva (utilizando equipamentos adequados e/ou procedimentos cirúrgicos), como em casos de câncer colorretal e câncer de pulmão ou pode ser executada através de incisões superficiais na pele, como no caso do melanoma.
Estabilidade das amostras: As amostras sólidas devem ser mergulhadas no fixador o mais rápido possível, para reduzir a degradação do DNA, com um prazo máximo de uma hora. Após o tratamento e processamento das amostras para inclusão em blocos de parafina, ocorrerá a análise do conteúdo tumoral. A porção destinada ao uso no Idylla™ deve ser armazenada entre 15-30°C por até 60 dias.
Transporte de amostras: As amostras de tecido em FFPE devem ser enviadas previamente seccionadas em formato de rolinhos (FFPE curls) e acondicionadas em microtubos plásticos, sem a adição de reagentes ou água (DNAse/RNAse free). A temperatura de transporte deve ser mantida entre 15 e 30 °C. Para garantir a integridade do material, é importante evitar agitações durante o transporte.
Critérios para rejeição da amostra: Fora do período de estabilidade, amostra congelada ou refrigerada, quantidade insuficiente de amostra coletada, amostra armazenada em tubo contendo reagentes ou água, amostras biológicas e/ou tubos não identificados adequadamente, tubos e/ou recipientes danificados e amostras FFPE coradas.
Indicação clínica: Pacientes com suspeita de doenças oncológicas decorrentes de alterações genéticas pulmonares (Câncer de pulmão de células não-pequenas – NSCLC).
Metodologia: Utilizando biópsias sólidas e a técnica de PCR em tempo real, é realizada a detecção automatizada de biomarcadores associados a doenças oncológicas. Após a inserção da amostra biológica (biópsia sólida) em um cartucho específico do Idylla™, ocorre uma combinação de reagentes químicos, enzimas, calor e ultrassom focalizado de alta intensidade (HIFU), que induzem a desparafinação, ruptura do tecido e lise das células. Os ácidos nucleicos são então liberados e amplificados através da técnica de PCR em tempo real, onde as sequências-alvo para os biomarcadores EGFR são detectadas por sondas marcadas com fluorescência.
Durante o processo de PCR em tempo real, são gerados sinais fluorescentes que são traduzidos em chamadas genéticas, permitindo ao software TTP interpretá-las automaticamente e gerar um relatório dos resultados (inválido, presença ou ausência de mutação).
Vantagens: O sistema Idylla™ desenvolvido para testes onco-moleculares é totalmente automatizado, reduzindo eficientemente o risco de contaminações cruzadas de reagentes e das amostras de biópsia. Com a utilização da técnica de PCR em tempo real qualitativa, os resultados são concluídos em um curto período. O ensaio de mutação Idylla™ EGFR detecta mutações nos éxons 18 (G719A/C/S), éxon 20 (T790M, S768I), éxon 21 (L858R,L861Q), deleções do éxon 19 e inserções do éxon 20 do gene EGFR.
Limitações da metodologia: A detecção de alterações não é possível, caso as amostras de biópsia sólida não contenham um número suficiente de células neoplásicas, sendo necessário ≥ 10% para EGFR.
Interferentes: O uso de amostras coradas ou embebidas em parafina com temperatura de fusão acima de 60 °C, pode gerar resultados inválidos e/ou incorretos.
Prazo: 3 dias
Preparo para o exame: O preparo para a coleta de biópsia sólida deve seguir as recomendações médicas, variando conforme a metodologia aplicada, seja ela invasiva ou não.
Amostra: Para amostras sólidas, um bloco de FFPE é suficiente se o tecido apresentar o número adequado de células neoplásicas, sendo ≥10% para GeneFusion. Do contrário, serão necessários múltiplos tecidos em FFPE para atender a esse requisito e nesse caso, a espessura do corte tecidual terá variação mínima e máxima, conforme indicado na tabela:
Coleta: A coleta de material biológico varia conforme o tipo de biópsia, que pode ser sólida (tecido e/ou tumor) ou líquida (plasma sanguíneo). A biópsia sólida pode ser realizada de forma invasiva (utilizando equipamentos adequados e/ou procedimentos cirúrgicos), como em casos de câncer colorretal e câncer de pulmão ou pode ser executada através de incisões superficiais na pele, como no caso do melanoma.
Estabilidade das amostras: As amostras sólidas devem ser mergulhadas no fixador o mais rápido possível, para reduzir a degradação do DNA, com um prazo máximo de uma hora. Após o tratamento e processamento das amostras para inclusão em blocos de parafina, ocorrerá a análise do conteúdo tumoral. A porção destinada ao uso no Idylla™ deve ser armazenada entre 15-30°C por até 60 dias.
Transporte de amostras: As amostras de tecido em FFPE devem ser enviadas previamente seccionadas em formato de rolinhos (FFPE curls) e acondicionadas em microtubos plásticos, sem a adição de reagentes ou água livre de DNAses/RNAses. A temperatura de transporte deve ser mantida entre 15-30°C. Para garantir a integridade do material, é importante evitar agitações durante o transporte.
Critérios para rejeição da amostra: Fora do período de estabilidade, amostra congelada ou refrigerada, quantidade insuficiente de amostra coletada, amostra armazenada em tubo contendo reagentes ou água, amostras biológicas e/ou tubos não identificados adequadamente, tubos e/ou recipientes danificados e amostras FFPE coradas.
Indicação clínica: Pacientes com suspeita de doenças oncológicas decorrentes de alterações genéticas pulmonares.
Metodologia: Utilizando biópsias sólidas e a técnica de PCR em tempo real, é realizada a detecção automatizada de biomarcadores associados a doenças oncológicas. Após a inserção da amostra biológica (biópsia sólida) em um cartucho específico do Idylla™, ocorre uma combinação de reagentes químicos, enzimas, calor e ultrassom focalizado de alta intensidade (HIFU), que induzem a desparafinação, ruptura do tecido e lise das células, ocorrendo então, a liberação de ácidos nucleicos (RNA e DNA). São adicionados o tampão de ligação e etanol e posteriormente, os ácidos nucleicos são purificados e concentrados em um suporte sólido. Após a eluição, há transcrição reversa de mRNA e amplificação dos através da técnica de PCR em tempo real, onde as sequências-alvo para os biomarcadores GeneFusion são detectadas por sondas marcadas com fluorescência.
Durante o processo de PCR em tempo real, são gerados sinais fluorescentes que são traduzidos em chamadas genéticas, permitindo ao software TTP interpretá-las automaticamente e gerar um relatório dos resultados (inválido, presença ou ausência de mutação).
Vantagens: O sistema Idylla™ desenvolvido para testes onco-moleculares é totalmente automatizado, reduzindo eficientemente o risco de contaminações cruzadas de reagentes e das amostras de biópsia. Com a utilização da técnica de PCR em tempo real qualitativa, os resultados são concluídos em um curto período. O ensaio de mutação Idylla™ GeneFusion detecta fusões gênicas específicas para ALK, ROS1, RET e MET (éxon 14 omitido) além do desequilíbrio de expressão para ALK, ROS1, RET.
Limitações da metodologia: A detecção de alterações não é possível, caso as amostras de biópsia sólida não contenham um número suficiente de células neoplásicas, sendo necessário ≥ 10% para GeneFusion.
Interferentes: O uso de amostras coradas ou embebidas em parafina com temperatura de fusão acima de 60 °C, pode gerar resultados inválidos e/ou incorretos.
Prazo: 3 dias
Preparo para o exame: O preparo para a coleta de biópsia sólida deve seguir as recomendações médicas, variando conforme a metodologia aplicada, seja ela invasiva ou não.
Amostra: Para amostras sólidas, um bloco de FFPE é suficiente se o tecido apresentar o número adequado de células neoplásicas, sendo ≥10% para KRAS. Do contrário, serão necessários múltiplos tecidos em FFPE para atender a esse requisito e nesse caso, a espessura do corte tecidual terá variação mínima e máxima, conforme indicado na tabela:
Coleta: A coleta de material biológico varia conforme o tipo de biópsia, que pode ser sólida (tecido e/ou tumor) ou líquida (plasma sanguíneo). A biópsia sólida pode ser realizada de forma invasiva (utilizando equipamentos adequados e/ou procedimentos cirúrgicos), como em casos de câncer colorretal e câncer de pulmão ou pode ser executada através de incisões superficiais na pele, como no caso do melanoma.
Estabilidade das amostras: As amostras sólidas devem ser mergulhadas no fixador o mais rápido possível, para reduzir a degradação do DNA, com um prazo máximo de uma hora. Após o tratamento e processamento das amostras para inclusão em blocos de parafina, ocorrerá a análise do conteúdo tumoral. A porção destinada ao uso no Idylla™ deve ser armazenada entre 15-30°C por até 60 dias.
Transporte de amostras: As amostras de tecido em FFPE devem ser enviadas previamente seccionadas em formato de rolinhos (FFPE curls) e acondicionadas em microtubos plásticos, sem a adição de reagentes ou água (DNAse/RNAse free). A temperatura de transporte deve ser mantida entre 15-30°C. Para garantir a integridade do material, é importante evitar agitações durante o transporte.
Critérios para rejeição da amostra: Fora do período de estabilidade, amostra congelada ou refrigerada, quantidade insuficiente de amostra coletada, amostra armazenada em tubo contendo reagentes ou água, amostras biológicas e/ou tubos não identificados adequadamente, tubos e/ou recipientes danificados e amostras FFPE coradas.
Indicação clínica: Pacientes com suspeita de doenças oncológicas decorrentes de alterações genéticas somáticas em câncer colorretal.
Metodologia: Utilizando biópsias sólidas e a técnica de PCR em tempo real, é realizada a detecção automatizada de biomarcadores associados a doenças oncológicas. Após a inserção da amostra biológica (biópsia sólida) em um cartucho específico do Idylla™, ocorre uma combinação de reagentes químicos, enzimas, calor e ultrassom focalizado de alta intensidade (HIFU), que induzem a desparafinização, ruptura do tecido e lise das células. Os ácidos nucleicos são então liberados e amplificados através da técnica de PCR em tempo real, onde as sequências-alvo para os biomarcadores KRAS são detectadas por sondas marcadas com fluorescência.
Durante o processo de PCR em tempo real, são gerados sinais fluorescentes que são traduzidos em chamadas genéticas, permitindo ao software TTP interpretá-las automaticamente e gerar um relatório dos resultados (inválido, presença ou ausência de mutação).
Vantagens: O sistema Idylla™ desenvolvido para testes onco-moleculares é totalmente automatizado, reduzindo eficientemente o risco de contaminações cruzadas de reagentes e das amostras de biópsia. Com a utilização da técnica de PCR em tempo real qualitativa, os resultados são concluídos em um curto período. O ensaio de mutação Idylla™ KRAS detecta mutações nos códons 12, 13, 59, 61, 117 e 146 do gene KRAS.
Limitações da metodologia: A detecção de alterações não é possível, caso as amostras de biópsia sólida não contenham um número suficiente de células neoplásicas, sendo necessário ≥ 10% para KRAS. Em caso de heterogeneidade de amostras ou múltiplas mutações, apenas a mutação dominantemente detectada é relatada por códon.
Interferentes: O uso de amostras coradas ou embebidas em parafina com temperatura de fusão acima de 60 °C, pode gerar resultados inválidos e/ou incorretos.
Prazo: 3 dias
Preparo para o exame: O preparo para a coleta de biópsia sólida deve seguir as recomendações médicas, variando conforme a metodologia aplicada, seja ela invasiva ou não.
Amostra: Para amostras sólidas, um bloco de FFPE é suficiente se o tecido apresentar o número adequado de células neoplásicas, sendo ≥ 20% para MSI. Do contrário, serão necessários múltiplos tecidos em FFPE para atender a esse requisito e nesse caso, a espessura do corte tecidual terá variação mínima e máxima, conforme indicado na tabela:
Coleta: A coleta de material biológico varia conforme o tipo de biópsia, que pode ser sólida (tecido e/ou tumor) ou líquida (plasma sanguíneo). A biópsia sólida pode ser realizada de forma invasiva (utilizando equipamentos adequados e/ou procedimentos cirúrgicos), como em casos de câncer colorretal e câncer de pulmão ou pode ser executada através de incisões superficiais na pele, como no caso do melanoma.
Estabilidade das amostras: As amostras sólidas devem ser mergulhadas no fixador o mais rápido possível, para reduzir a degradação do DNA, com um prazo máximo de uma hora. Após o tratamento e processamento das amostras para inclusão em blocos de parafina, ocorrerá a análise do conteúdo tumoral. A porção destinada ao uso no Idylla™ deve ser armazenada entre 15-30°C por até 60 dias.
Transporte de amostras: As amostras de tecido em FFPE devem ser enviadas previamente seccionadas em formato de rolinhos (FFPE curls) e acondicionadas em microtubos plásticos, sem a adição de reagentes ou água livre de DNAses/RNAses. A temperatura de transporte deve ser mantida entre 15-30°C. Para garantir a integridade do material, é importante evitar agitações durante o transporte.
Critérios para rejeição da amostra: Fora do período de estabilidade, amostra congelada ou refrigerada, quantidade insuficiente de amostra coletada, amostra armazenada em tubo contendo reagentes ou água, amostras biológicas e/ou tubos não identificados adequadamente, tubos e/ou recipientes danificados e amostras FFPE coradas.
Indicação clínica: Pacientes com suspeita de doenças oncológicas decorrentes de instabilidade de microssatélites em câncer colorretal.
Metodologia: Utilizando biópsias sólidas e a técnica de PCR em tempo real, é realizada a detecção automatizada de biomarcadores associados a doenças oncológicas. Após a inserção da amostra biológica (biópsia sólida) em um cartucho específico do Idylla™, ocorre uma combinação de reagentes químicos, enzimas, calor e ultrassom focalizado de alta intensidade (HIFU), que induzem a desparafinação, ruptura do tecido e lise das células. Os ácidos nucleicos são então liberados e amplificados através da técnica de PCR em tempo real, onde as sequências-alvo para os marcadores de instabilidade de microssatélites são detectadas por sondas marcadas com fluorescência.
Durante o processo de PCR em tempo real, são gerados sinais fluorescentes que são traduzidos em chamadas genéticas, permitindo ao software TTP interpretá-las automaticamente e gerar um relatório dos resultados (inválido, presença ou ausência de mutação).
Vantagens: O sistema Idylla™ desenvolvido para testes onco-moleculares é totalmente automatizado, reduzindo eficientemente o risco de contaminações cruzadas de reagentes e das amostras de biópsia. Com a utilização da técnica de PCR em tempo real qualitativa, os resultados são concluídos em um curto período. O ensaio de mutação Idylla™ MSI detecta instabilidade de microssatélites específicas nos genes ACVR2A, BTBD7, DIDO1, MRE11, RYR3, SEC31A e SULF2.
Limitações da metodologia: A detecção de alterações não é possível, caso as amostras de biópsia sólida não contenham um número suficiente de células neoplásicas, sendo necessário ≥ 20% para MSI.
Interferentes: O uso de amostras coradas ou embebidas em parafina com temperatura de fusão acima de 60 °C, pode gerar resultados inválidos e/ou incorretos.
Prazo: 3 dias
Preparo para o exame: O preparo para a coleta de biópsia sólida deve seguir as recomendações médicas, variando conforme a metodologia aplicada, seja ela invasiva ou não.
Amostra: Para amostras sólidas, um bloco de FFPE é suficiente se o tecido apresentar o número adequado de células neoplásicas, sendo ≥10% para NRAS-BRAF. Do contrário, serão necessários múltiplos tecidos em FFPE para atender a esse requisito e nesse caso, a espessura do corte tecidual terá variação mínima e máxima, conforme indicado na tabela:
Coleta: A coleta de material biológico varia conforme o tipo de biópsia, que pode ser sólida (tecido e/ou tumor) ou líquida (plasma sanguíneo). A biópsia sólida pode ser realizada de forma invasiva (utilizando equipamentos adequados e/ou procedimentos cirúrgicos), como em casos de câncer colorretal e câncer de pulmão ou pode ser executada através de incisões superficiais na pele, como no caso do melanoma.
Estabilidade das amostras: As amostras sólidas devem ser mergulhadas no fixador o mais rápido possível, para reduzir a degradação do DNA, com um prazo máximo de uma hora. Após o tratamento e processamento das amostras para inclusão em blocos de parafina, ocorrerá a análise do conteúdo tumoral. A porção destinada ao uso no Idylla™ deve ser armazenada entre 15-30°C por até 60 dias.
Transporte de amostras: As amostras de tecido em FFPE devem ser enviadas previamente seccionadas em formato de rolinhos (FFPE curls) e acondicionadas em microtubos plásticos, sem a adição de reagentes ou água (DNAse/RNAse free). A temperatura de transporte deve ser mantida entre 15-30°C. Para garantir a integridade do material, é importante evitar agitações durante o transporte.
Critérios para rejeição da amostra: Fora do período de estabilidade, amostra congelada ou refrigerada, quantidade insuficiente de amostra coletada, amostra armazenada em tubo contendo reagentes ou água, amostras biológicas e/ou tubos não identificados adequadamente, tubos e/ou recipientes danificados e amostras FFPE coradas.
Indicação clínica: Pacientes com suspeita de doenças oncológicas decorrentes de alterações genéticas em câncer colorretal.
Metodologia: Utilizando biópsias sólidas e a técnica de PCR em tempo real, é realizada a detecção automatizada de biomarcadores associados a doenças oncológicas. Após a inserção da amostra biológica (biópsia sólida) em um cartucho específico do Idylla™, ocorre uma combinação de reagentes químicos, enzimas, calor e ultrassom focalizado de alta intensidade (HIFU), que induzem a desparafinização, ruptura do tecido e lise das células. Os ácidos nucleicos são então liberados e amplificados através da técnica de PCR em tempo real, onde as sequências-alvo para os biomarcadores NRAS-BRAF são detectadas por sondas marcadas com fluorescência.
Durante o processo de PCR em tempo real, são gerados sinais fluorescentes que são traduzidos em chamadas genéticas, permitindo ao software TTP interpretá-las automaticamente e gerar um relatório dos resultados (inválido, presença ou ausência de mutação).
Vantagens: O sistema Idylla™ desenvolvido para testes onco-moleculares é totalmente automatizado, reduzindo eficientemente o risco de contaminações cruzadas de reagentes e das amostras de biópsia. Com a utilização da técnica de PCR em tempo real qualitativa, os resultados são concluídos em um curto período. O ensaio de mutação Idylla™ NRAS-BRAF detecta mutações nos códons 12, 13, 59, 61, 117, 146 do gene NRAS, no códon 600 do gene BRAF.
Limitações da metodologia: A detecção de alterações não é possível, caso as amostras de biópsia sólida não contenham um número suficiente de células neoplásicas, sendo necessário ≥ 10% para NRAS-BRAF.
Interferentes: O uso de amostras coradas ou embebidas em parafina com temperatura de fusão acima de 60 °C, pode gerar resultados inválidos e/ou incorretos.
Prazo: 3 dias
